まず、bat ファイルに以下を記述する

ftp -nis:"file name" [FTP server]

次に、"file name"で指定したファイルに以下を記述する

user [user name] [password] bin mput [file name] quit

[user name]、[password] は、[FTP server] のアカウントとパスワード。
[file name] は、[FTP sever] に送りたいファイルを指定する。

これで、上記 bat ファイルを実行すると、
FTP が実行されてファイルを送信することができる。

さらに、FTP を定期的に自動実行したい場合は、
タスクスケジューラで上記 bat ファイルを定期的に実行すれば良い。